幼稚園の子どもたちがハチの大群に襲われてパニックに！その原因をつきとめて問題を解決するためアトムたちはミッションを開始します。
アトニャンはハチを退治しようと言うけれど、お茶の水博士からは「ハチのことも考えてあげるんじゃ」とアドバイスが。チームアトムはミニロボモードを使ってハチの女王と話してみることにしますが…。
はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？